Si le Cimetière aux Bourguignons n’a pas été défriché, c’est parce que c’est une des régions les plus sauvages et les plus accidentées du Jura. On y trouve de nombreux phénomènes de dissolution superficielle du calcaire tels que des lapiés, également plusieurs dizaines d’entrées de grottes.
Dans cette forêt se situent de nombreux trous dont on ne peut clairement voir le fond. Ils sont probablement reliés à des petites galeries, elles-mêmes reliées à un réseau souterrain plus important.